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    高光譜技術(shù)在植物表型研究中的應(yīng)用(1)

    發(fā)布時(shí)間: 2022-06-13  點(diǎn)擊次數(shù): 3206次

    植物學(xué)研究領(lǐng)域,我們掌握基因組的能力已遠(yuǎn)超測(cè)量其對(duì)表型影響的能力。為應(yīng)對(duì)這個(gè)不平衡的現(xiàn)狀,近年來(lái)對(duì)植物表型研究的投入漸多,光學(xué)測(cè)量方法因其速度快、無(wú)損傷、可長(zhǎng)期追蹤監(jiān)測(cè)等優(yōu)勢(shì)而發(fā)展迅速,其中HSI(高光譜成像)可適應(yīng)實(shí)驗(yàn)室、溫室、野外各種場(chǎng)景;可應(yīng)用于細(xì)胞、葉片、冠層、遙感各種尺度;可實(shí)現(xiàn)便攜、實(shí)驗(yàn)室靜態(tài)系統(tǒng)、拖拉機(jī)和越野車(chē)、無(wú)人機(jī)、船、衛(wèi)星各種搭載方案。因此高光譜技術(shù)在植物表型測(cè)量、實(shí)現(xiàn)作物優(yōu)化管理領(lǐng)域應(yīng)用廣泛。澳大利亞拉籌伯大學(xué)的Rijad Sari?等學(xué)者同國(guó)際植物表型設(shè)備廠商捷克PSI公司的CEO Martin Trtilek博士,于20211月在Trends in Plant Science雜志共同發(fā)表綜述,全面介紹了高光譜技術(shù)在植物表型測(cè)量應(yīng)用中的原理、技術(shù)和應(yīng)用現(xiàn)狀:HSI測(cè)量夠得到植物的葉綠素、葉黃素、類(lèi)胡蘿卜素、花青素、氮、水分、磷、纖維素、蛋白質(zhì)、礦物質(zhì)、酚類(lèi)等代謝物狀況信息;植物組織的細(xì)胞結(jié)構(gòu)、角質(zhì)層厚度、細(xì)胞垛疊方式等導(dǎo)致的表面紋理特性的變化信息;植物冠層結(jié)構(gòu)和形態(tài)信息等;可應(yīng)用于植物生理生化研究、種子活力評(píng)估、光合及呼吸、根系表型、病蟲(chóng)害和非生物脅迫研究、產(chǎn)量預(yù)測(cè)和農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量檢測(cè)等植物表型研究及應(yīng)用領(lǐng)域。

    以下為利用手持式高光譜儀及高光譜成像技術(shù)研究作物表型的應(yīng)用案例,謹(jǐn)供參考,歡迎垂詢(xún)

    1.VIS-NIR波段高光譜技術(shù)應(yīng)用于水稻含磷狀況評(píng)估和全基因組關(guān)聯(lián)分析

    磷是植物重要的宏量營(yíng)養(yǎng)元素,缺磷會(huì)立刻影響電子傳遞和CO2同化(Carstensen A,2018),從而影響作物的生長(zhǎng)發(fā)育和產(chǎn)量。缺磷植物葉片會(huì)表現(xiàn)出缺綠或者萎黃,高光譜特性隨之改變。泰國(guó)朱拉隆功大學(xué)的Sompop Pinit等人測(cè)定172種水培小麥在3P濃度(過(guò)量P100、輕度缺乏P5、重度缺乏P0.25)情況下的葉片無(wú)機(jī)P含量;并使用手持式高光譜測(cè)量?jī)xPolyPen RP400測(cè)量其相應(yīng)的反射光譜,選用720-790 nm近紅外波段、綠-黃波段和紅邊波段進(jìn)行指數(shù)計(jì)算,得到的P缺乏程度估算的準(zhǔn)確性可達(dá)85.6%,該方法和全波段光譜的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型預(yù)測(cè)準(zhǔn)確性相近。同時(shí)研究者應(yīng)用217個(gè)反射指數(shù)進(jìn)行113114個(gè)SNPs的全基因組關(guān)聯(lián)研究,識(shí)別到11個(gè)與光譜反射特征相關(guān)的位點(diǎn),其中一些與葉片P含量相關(guān)。研究認(rèn)為,高光譜測(cè)量是估算植物含P狀態(tài)和篩選可高效利用P品種的可靠方法。


    2.VIS-NIR波段HSI技術(shù)應(yīng)用于煙草花葉病毒感染早期識(shí)別與定量分級(jí)

    病害可導(dǎo)致植物組織化學(xué)成分的變化,據(jù)此,Del Fiore等人應(yīng)用HSI方式快速識(shí)別玉米產(chǎn)毒真菌的感染;Mahlei等人應(yīng)用HSI技術(shù)區(qū)分3種甜菜病害(葉斑病、白粉病、葉銹?。┑取M瑫r(shí),病害也會(huì)引起植物組織呼吸速率、形態(tài)、葉色、細(xì)胞結(jié)構(gòu)、作物密度等物理性狀的變化,HSI同樣可作為有效的識(shí)別工具。浙江大學(xué)Hongyan Zhu等人(2017)應(yīng)用450-1000nm 波段范圍HSI技術(shù),應(yīng)用煙草花葉病毒感染性狀對(duì)應(yīng)的特征波段,結(jié)合其灰度共生矩陣提取的煙草葉片紋理特征建立機(jī)器學(xué)習(xí)模型,對(duì)感染病毒48小時(shí)煙草葉片識(shí)別準(zhǔn)確度達(dá)90%,健康葉片達(dá)100%,實(shí)現(xiàn)了病害早期檢測(cè)及程度量化分級(jí)。

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    參考文獻(xiàn):

    [1] Zhu, H et al. (2017) Hyperspectral imaging for presymptomatic detection of tobacco disease with successive projections algorithm and machine-learning classifiers. Sci. Rep 7,412

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    [3] Rijad Sari? et al. (2021) Applications of hyperspectral imaging in plant phenotyping. Trends in Plant Science, TRPLSC 2236 No. of Pages 15


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